朱元璋规定，官吏贪污钱财达到白银60两，就一律斩首。这还不算，为了加强警示作用，还要剥去贪官的人皮缝好，在里面填充稻草，做成人形皮袋示众。各州县衙门旁边的土地庙，就是剥人皮的场所。在公堂上官员的座位的两旁，都悬挂一个填满稻草的人形皮袋。官吏上堂，坐在这样的座位上办公，不得不毛骨悚然。
1380年，胡惟庸案之后，朱元璋以这件事为契机，决定废除中书省编制和宰相职位。为了集中权力，他不再设“代天子理万机”的宰相，而是由皇帝自专宰相的事权，赏罚予夺，全凭自己一人说了算。
自秦汉以来，宰相一直是与君主相互依存又相互制约的力量。朱元璋废除宰相，是中国政治制度史上的一件大事，皇权的专制统治进一步加强了。皇帝直接向各部发号施令，六部长官（尚书）直接向皇帝负责。
朱元璋一个助手也不要，完全靠自己来日理万机，干了一段时间以后，累得不行，不得不成立一个内阁，召集几位大学士辅政。内阁大学士在奏章或案件上，写出对该事的分析，作如何应对的建议，并拟好皇帝颁发命令的草稿，称为“票拟”和“条旨”，这些大学士实际做的是秘书工作。皇帝则根据大学士作的建议，根据自己的判断做出决定、批示，然后下发命令。